Gen bankası koleksiyonlarındaki boşlukları haritalamak veya yapmaya çalışmak - Tarımsal Biyoçeşitlilik Web Günlüğü

Dolayısıyla, bu gönderinin asıl fikri, erişim yerelliği verilerini son zamanlarda karşılaştığım iki yeni çevrimiçi haritalama aracına nasıl beslediğimi ve hatta belki de sonuçları birleştirdiğimi belgelemekti. Tam olarak bu şekilde olmadı, ancak bunu gerçekleştirmek için epey zaman harcadım, bu yüzden yine de ondan bir tür blog yazısı çıkarmak istiyorum. İşte başlıyor.
İki yeni araç: Benim düşüncem, Genesys'den bir mahsulün yerel türleri için bir grup yerellik elde etmek, bunları erişilebilirlik aracına bağlamak ve ardından bunun çıktısını söz konusu bölgedeki mahsul için genel uygunluk haritası ile karşılaştırmaktı. Sonuç: mahsul için uygun ancak mevcut gen bankası erişim noktalarından uzak alanlar Yani, daha fazla toplama için öncelikler.
Ya da toplamaya öncelik vermek için en az bir olası yaklaşım. İlk kısım yeterince kolaydı. Yemen'den arpa erişimlerine dair konum verilerini Genesys'den aldım, CSV dosyasıyla biraz uğraştım, onu erişilebilirlik aracına yükledim, çalıştırdım ve sonunda Google Earth'e yükleyebileceğiniz bir GeoTIFF indirdim.
Bir sonraki adım o kadar kolay değildi. Mahsul-İklime Uygunluk Haritalama aracından Yemen'deki arpa için mantıklı bir harita elde edemedim. Ve denedim. Çok. Elimdeki tek şey, tüm Yemen’in arpa için “karamsar” olarak sınıflandırılmasıydı ki bu doğru olamaz. "Maksimum tarım kapsamı" fena değildi, ancak parametrelerle uğraşmak, arpanın o alanda yetişmesinin beklenebileceği çılgın bir gösteri üretmeme izin vermedi.
Ama başarılı olsam bile, net değildi sonuçları aracın sınırları dışında nasıl kullanabilirdim. Yemen'de tarımın olduğu her yerde arpa için son derece kötü olduğunu gösteren bunun gibi bir ekran görüntüsü dışında bulabildiğim haritayı indirmenin bir yolu yok (kırmızı "kötümser" anlamına gelir, turuncu sadece uygun değildir). Ancak şimdiden epey bir zaman harcadıktan sonra SPAM'a geri dönmeye karar verdim.
Mekansal Üretim Tahsis Modeli, mahsul uygunluğu haritalaması için hala başvurulacak araç gibi görünüyor. Ve arpa için olan bu gibi çevrimiçi yapabileceğiniz haritalar güzel. Bununla birlikte, bununla yapabileceğiniz pek bir şey yok.
Genesys erişimlerini aynı menüden eşleyebilirsiniz, ancak ne yazık ki, uygunluk sonuçlarıyla aynı harita üzerinde değil. Bununla birlikte, SPAM, çok sayıda küresel GeoTIFF'in bir parçası olarak gelen arpa için indirilebilir veriler de sağlar. Bunu erişilebilirlik haritasıyla birlikte Google Earth’e yükledim.
Tamam, harika değil, kabul ediyorum. Google Earth'e içe aktarıldığında hem erişilebilirlik hem de SPAM sonuçlarındaki renk kayboldu, bu nedenle artık uygunluk, koyu çizgilerden daha açık renk ve erişilebilirliktir. Katmanları üst üste bindirdim, böylece herhangi bir açık renk görürseniz, bu, arpa için uygun olan ancak diğer arpa erişim yerlerinden görece erişilemeyen yerleri gösterir (sarı daireler).
Bunlar sizin öncelikli toplama yeriniz olabilir, Diğer bir deyişle. Yani harika değil, ama fena da değil. En azından bir sohbet başlatıcı olarak.
Beni hayal kırıklığına uğratmayın, aşağıda bir konuşma başlatın….